Die exakte Quantifizierung von NGS-Libraries ist wichtig, um über alle Sequenzierläufe hinweg eine gleichbleibende und optimale Datenqualität und Datenauswertung zu gewährleisten.
Insbesondere bei Illumina-Libraries ist die exakte Quantifizierung notwendig, um eine optimale Clusterdichte zu erreichen.
Die derzeit beste Methode zur Quantifizierung ist die qPCR, mit der Sie vollständige und somit sequenzierbare Libraries messen. Im Vergleich dazu sind die üblichen alternativen Methoden wie Elektrophorese oder Spektrometrie-Verfahren deutlich ungenauer.
Das NEBNext Library Quant Kit ist optimiert für eine besonders genaue, spezifische und reproduzierbare Quantifizierung von Illumina-NGS-Libraries. Es ist damit das derzeit beste System am Markt und besonders einfach und schnell anzuwenden, denn es wird Ihnen als praktisches Master Mix System mit einem zuverlässigen „one for all“ qPCR-Protokoll für alle GC-Gehalte und Library Insert-Längen ausgeliefert.
- qPCR basiertes System für genaueste und reproduzierbare Quantifizierung von Illumina Libraries
- Zuverlässiges Master-Mix-System für einfache und schnelle Anwendung
- Simples „one-for-all“ qPCR-Protokoll für alle Library Insert-Längen (150-1000 bp)
- Besonders flexibel: nutzen Sie wahlweise 4 oder 6 Standards (im Kit enthalten)
- Benötigt nur die Zugabe von Primern: Wird mit praktischen Library Dilution Buffer und NEBNext Library Quant Master Mix ausgeliefert
Überzeugen Sie sich selbst von den Vorteilen einer exakten Library-Quantifizierung und bestellen Sie ein kostenfreies Sample des NEBNext Library Quant Kit!
Feature Article:
“The Quantitation Question: How does accurate library quantitation influence sequencing?”
Durch die Quantifizierung von Libraries mit dem NEBNext Library Quant Kit lässt sich eine optimale Clusterdichte unabhängig von der Library-Größe und dem GC-Gehalt erreichen
Libraries of 310–963 bp from the indicated sources were quantitated using the NEBNext Library Quant Kit, then diluted to 8 pM and loaded onto a MiSeq® (v2 chemistry; MCS v2.4.1.3). Library concentrations ranged from 7–120 nM, and resulting raw cluster density for all libraries was 965–1300 k/mm2 (ave. =1199). Optimal cluster density was achieved using concentrations determined by the NEBNext Library Quant Kit for all library sizes.
Das NEBNext Library Quant Kit liefert stabile, reproduzierbare Quantifizierungs-Ergebnisse
Three 340–400 bp libraries were quantitated by 4 different users 2–4 times using either the NEBNext or KapaTM Library Quantification Kit (Universal). A notable improvement in quantitation consistency was observed for concentrations determined by the NEBNext Kit (orange) versus those from the Kapa kit (gray).
Durch Quantifizierung mit dem NEBNext Library Quant Kit erreichen Sie eine optimale Cluster-Dichte
Seven different libraries were quantitated using either the NEBNext Library Quant Kit (orange) or the Kapa Library Quantification Kit (Universal) (gray). Undiluted library concentrations ranged from 2–200 nM. Libraries were diluted to 8 pM and loaded onto a MiSeq® instrument (v2 chemistry; MCS v2.4.1.3). Libraries quantitated with the NEBNext kit resulted in a raw cluster density average of 1160 k/mm2, directly in the optimal range of 900–1300 k/mm2. In contrast, libraries loaded based on the Kapa quantitation averaged only 660 k/mm2.
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